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El virus de la inmunodeficiencia felina (FIV) es un patógeno ampliamente difundido en los gastos domésticos y especies felinos salvajes relacionadas en todo el mundo. El genoma del virus incluye la mayor parte de los genes estructurales de los retrovirus, así como genes accesorios que le permiten desarrollar las funciones esenciales de su ciclo vital.

Diferentes cepas de FIV aisladas muestran importantes diferencias en su patogenicidad, que permiten clasificarlas como altamente patógenas o de baja patogenicidad. Un estudio* llevado a cabo en la Facultad de Veterinaria de Viena (Austria) ha analizado el transcriptoma viral de dos cepas de FIV con muy diferente virulencia (Petaluma y Glasgow 8) mediante la utilización de técnicas de secuenciación de segunda generación (SCS). Los niveles de expresión de los genes virales detectados de esta forma han sido determinados también por PCR cuantitativa de transcripción inversa, para comparar los dos métodos de cuantificación del ARNm.

En resumen, el análisis SGS reveló niveles de ARNm constantes para la mayoría de los genes virales entre el aislado poco patógeno Petaluma y el altamente patógeno Glasgow 8. Se observaron diferencias notables entre las dos cepas de FIV en la unión de ARNm vírico donde Glasgow 8 muestra semejanzas con el modelo de transcripción visto en los estadios tempranos de las infecciones por lentivirus. Por tanto, las divergencias en la regulación del procesamiento de ARN post-transcripcional podría ser un factor adicional a los variados efectos patogénicos de los aislados individuales de FIV.

En conjunto, este estudio ha tenido como objetivo investigar el transcriptoma vírico como parte de la compleja red de interacciones entre el virus y el hospedador, lo que contribuirá a conseguir nuevos y profundos puntos de vista sobre la patogenia del FIV.

*Ertl R, Birzele F, Hildebrandt T, Klein D. Viral transcriptome analysis of feline immunodeficiency virus infected cells using second generation sequencing technology. Vet Immunol Immunopathol. 2011 Jun 22