El tema de la edición 2009 del Premio MERCOSUR de Ciencia y Tecnología, fue la Agroindustria. En la categoría de ´Iniciación Científica´, el premio fue para un trabajo sobre obtención de un bagazo azucarero aglutinado con una fécula, obra de dos jóvenes paraguayos del Colegio Iberoamericano. En la categoría ´Estudiantil´, una brasilera de la Universidad Federal de Rio Grande obtuvo el premio y en la categoría de ´Joven Investigador´ lo logró otra brasilera, por su investigación sobre concentración de extractos de propóleos por nanofiltración. La categoría ´Integración´ fue para un estudio sobre el aprovechamiento de efluentes de quesería para la elaboración de probióticos, trabajo de un equipo científico conformado mayoritariamente por argentinos, a los que acompañaron dos colombianos y un chileno.
La entrega de los premios fue llevada a cabo en Montevideo (Uruguay) el pasado jueves 12 de noviembre de 2009.
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