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La resistencia a los antimicrobianos es una gran amenaza para la salud mundial, y ha provocado presión sobre la industria ganadera para que elimine el uso de antibióticos promotores del crecimiento (APC) como aditivos para piensos. Para mitigar su eliminación se requieren alternativas eficaces.

Se cree que los APC operan mediante la modulación del microbioma intestinal para limitar las oportunidades de colonización por patógenos, aumentar la utilización de nutrientes y reducir la inflamación. Sin embargo, se sabe poco sobre los mecanismos subyacentes. Los estudios previos que investigaron los efectos de los APC en el microbioma intestinal de las aves de corral se han centrado en gran medida en las encuestas de ADNr 16S basadas en un solo sitio gastrointestinal, dieta o punto de tiempo, lo que da como resultado una visión inconsistente de su impacto en la composición comunitaria.

Ahora, en un nuevo estudio se ha realizado una investigación sistemática tanto de la composición como de la función del microbioma intestinal de pollo, en respuesta a los APC. Las aves se criaron con dos dietas y tratamientos de APC diferentes, y se aplicaron encuestas de ADNr 16S en seis sitios gastrointestinales muestreados en tres momentos clave del ciclo de vida de las aves. Las investigaciones funcionales se realizaron mediante análisis de metatranscriptómica y metabolómica.

Una visión más matizada

El estudio revela una visión más matizada del impacto de los ACP, dependiendo de la edad del ave, la dieta y el sitio intestinal muestreado. Aunque los ACP tienen un impacto limitado en la abundancia taxonómica, parecen redefinir taxones influyentes que pueden promover la exclusión de otros taxones.

Los perfiles de expresión del microbioma revelan además un panorama complejo tanto en la expresión como en la representación taxonómica de múltiples vías que incluyen la biogénesis de la pared celular, la resistencia a los antimicrobianos y varias involucradas en el metabolismo de la energía, los aminoácidos y los nucleótidos. Es probable que muchos cambios inducidos por los ACP en la expresión de enzimas metabólicas sirvan para redirigir el flujo metabólico con el potencial de regular el crecimiento bacteriano o producir metabolitos que afectan al huésped.

A medida que se desarrollan aditivos alimentarios alternativos para imitar la acción de los ACP, el estudio destaca la necesidad de garantizar que tales alternativas produzcan cambios funcionales que sean consistentes con los taxones asociados con el sitio, la edad y la dieta. Por lo tanto, se espera que los genes y las vías identificados en el estudio impulsen estudios futuros, aplicando herramientas como el modelado metabólico basado en la comunidad, centrándose en el impacto mecánico de diferentes regímenes dietéticos en el microbioma.

En consecuencia, los datos generados en este estudio serán cruciales para el desarrollo de aditivos alimentarios de próxima generación dirigidos a la salud intestinal y la producción avícola.

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Zou, A., Nadeau, K., Xiong, X. et al. Systematic profiling of the chicken gut microbiome reveals dietary supplementation with antibiotics alters expression of multiple microbial pathways with minimal impact on community structure. Microbiome 10, 127 (2022). https://doi.org/10.1186/s40168-022-01319-7